La struttura di NutriAid International è costituita da una componente direzionale rappresentata dall'Assemblea dei Soci, dal Consiglio Internazionale, affiancato dal Collegio dei Garanti e dal Collegio dei Sindaci, dal Presidente, affiancato dal Vicepresidente, e da una componente operativa, che, in seguito alla defnizione degli obiettivi a medio-lungo termine, predispone la proposta di raccolta fondi e sensibilizzazione al fine di attuare la realizzazione dei progetti previsti dal Consiglio Internazionale nella fase strategica.

Le 4 Unità, Progetti, FR e comunicazione, UMS e amministrativa sono coordinate da un Responsabile, rappresentato da una persona con specifiche competenze nell'ambito di quella particolare Unità.